《小魔女DoReMi第二部》讲述即将升上四年级的DoReMi、羽月、小爱及音符已经成为好朋友，但同时也失去魔女身份。一天晚上，她们四人回到了魔法堂想见魔女莉卡一面，而在无意间发现魔女莉卡所遗留下来的吹风机(其实是女王变出来，引导DoReMi一行进入魔女界的工具)，因此想借口把吹风机送回给魔女莉卡以重回魔女世界。在女王刻意安排下，她们四人穿过女王的玫瑰花园，并撞见一位魔女婴儿在皇后玫瑰花中诞生（皇后玫瑰花为一百年开一朵的珍贵的玫瑰花，由其中出生魔力特强的魔女将是未来魔女女王的候选人，按规定撞见魔女婴儿诞生者有扶养之义务）。在大部分的魔女持反对意见之下，女王吩咐她们要照顾这魔女婴儿一年，并恢复她们魔女见习生的身份。期间DoReMi等人要接受九次魔女婴儿定期健康检查，若是任一次检查不合格，魔女婴儿就要送回魔女世界。这魔女婴儿后来由DoReMi命名为小花，意思是从花朵诞生的婴儿。在众人的照顾下小花渐渐长大懂事，但其强大的魔力也带给她们不少麻烦。